PuSH - Publication Server of Helmholtz Zentrum München

Large scale knowledge extraction from biomedical literature based on semantic role labeling.

Wissensextraktion im Großmaßstab aus biomedizinischen Texten mittels Semantic Role Labeling.

München, Technische Universität, Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan, Diss., 2010, 169 S.
Full text
as soon as is submitted to ZB.
This doctorate aimed at the development of a broad scale text mining approach covering a multitude of relation types (e.g. activation, inhibition, phosphorylation and others) as well as entity types (e.g. genes, metabolites, diseases and others). The resulting text mining system EXCERBT was developed, optimized and evaluated in hindsight on practical usability for systems biology. The system is characterized in technical hindsight by high processing speed and easy extensibility. EXCERBT is a semantic search engine for biomedical texts additionally comprising a new approach for automatically generating biomedical lexica.
Ziel der vorliegenden Doktorarbeit war die Entwicklung eines auf breiter Basis anwendbaren Textmining Systems, welches in der Lage ist, eine Vielzahl an Relationen (Aktivierung, Inhibierung, Phosphorylierung u.a.) zwischen verschiedenen Entitäten (Gene, Metaboliten, Krankheiten u.a.) aus der Fachliteratur zu extrahieren. Das aus der Arbeit hervorgehende Softwaresystem EXCERBT wurde primär hinsichtlich seiner praktischen Anwendbarkeit für systembiologische Fragestellungen entwickelt, optimiert und evaluiert. Es zeichnet sich in technischer Hinsicht durch hohe Verarbeitungsgeschwindigkeit und Erweiterbarkeit aus. EXCERBT ist eine semantische, biomedizinische Suchmaschine und beinhaltet darüber hinaus ein neues Verfahren zur automatischen Generierung biomedizinischer Lexika.
Additional Metrics?
Edit extra informations Login
Publication type Other: Thesis
Thesis type Doctoral thesis
University Technische Universität
University place München
Faculty Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
Reviewing status