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Predicting virulence factors in filamentous fungi: Regulation and evolution of secondary metabolism gene clusters.

Vorhersage von Virulenzfaktoren in filamentösen Pilzen: Regulation und Evolution von Sekundärmetabolismus-Genclustern.

München, Technische Universität, Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan, Diss., 2015, 170 S.
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Genomic sequences of pathogenic filamentous fungi encode a broad repertoire of virulence factors and secondary metabolism genes. In this thesis we apply computational methods to predict genes that contribute to virulence, use comparative genomics approaches to identify species specific features and integrate multiple ‘omics’ data to uncover regulatory mechanisms during host infection. The results of this work not only identify species specific, virulence related features and give insight into the regulation of secondary metabolism but also reveal evolutionary processes that shed light on the origin of secondary metabolism gene clusters.
Genomsequenzen pathogener filamentöser Pilze kodieren ein breites Spektrum an Virulenzfaktoren und Sekundärmetabolismus-Genen. In dieser These wenden wir bioinformatische Methoden an um Virulenzgene zu identifizieren, bestimmen mithilfe vergleichender Genomik artspezifische Eigenschaften, und decken regulatorische Mechanismen durch die Integration biologischer Daten aus unterschiedlichen Experimenten auf. Die Ergebnisse aus dieser Arbeit identifizieren nicht nur artspezifische, virulenzbezogene Eigenschaften und bieten Einblick in die Sekundärmetabolismus-Regulation, sondern decken auch evolutionäre Abläufe auf, die Aufschluss über die Herkunft von Sekundärmetabolismus-Genclustern geben.
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Publication type Other: Thesis
Thesis type Doctoral thesis
University Technische Universität
University place München
Faculty Fakultät Wissenschaftszentrum Weihenstephan
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