PuSH - Publication Server of Helmholtz Zentrum München

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Shared heritability and functional enrichment across six solid cancers.

Nat. Commun. 10:431 (2019)
Publishers Version Research data DOI
Open Access Gold
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as soon as is submitted to ZB.
Quantifying the genetic correlation between cancers can provide important insights into the mechanisms driving cancer etiology. Using genome-wide association study summary statistics across six cancer types based on a total of 296,215 cases and 301,319 controls of European ancestry, here we estimate the pair-wise genetic correlations between breast, colorectal, head/neck, lung, ovary and prostate cancer, and between cancers and 38 other diseases. We observed statistically significant genetic correlations between lung and head/neck cancer (r(g) = 0.57, p = 4.6 x 10(-8)), breast and ovarian cancer (r(g) = 0.24, p = 7 x 10(-5)), breast and lung cancer (r(g) = 0.18, p = 1.5 x 10(-6)) and breast and colorectal cancer (r(g) = 0.15, p = 1.1 x 10(-4)). We also found that multiple cancers are genetically correlated with non-cancer traits including smoking, psychiatric diseases and metabolic characteristics. Functional enrichment analysis revealed a significant excess contribution of conserved and regulatory regions to cancer heritability. Our comprehensive analysis of cross-cancer heritability suggests that solid tumors arising across tissues share in part a common germline genetic basis.
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Publication type Article: Journal article
Document type Scientific Article
Keywords Genome-wide Association; Susceptibility Loci; Breast-cancer; Risk-factors; Lung-cancer; Partitioning Heritability; Mendelian Randomization; Genetic Architecture; Analyses Identify; Cell-types
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