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Titel:

Analysis of cell lineage trees by exact bayesian inference identifies negative autoregulation of nanog in mouse embryonic stem cells.


Titel Pressemitteilung:

Zu viel ist zu viel - Stammzellfaktor Nanog bremst sich selbst

Enough is enough - stem cell factor Nanog knows when to slow down

Apr 2017 ICB
SAM
G-503800-001
Dr. Carsten Marr PDF
PM DE: PDF
PM EN: PDF
WB 2017-06-01
PR 2016-11-01
Publikation
Core statement:

Fitting stochastic models to single-cell fluorescent lineage trees identifies regulatory self-inhibition of the pluripotency factor Nanog.

 


Core statement Pressemitteilung:

Der Transkriptionsfaktor Nanog spielt eine entscheidende Rolle bei der Selbsterneuerung von Stammzellen. Unklar war bisher, wie seine Menge in den Zellen geregelt wird. Forscher des Helmholtz Zentrums München und der Technischen Universität München berichten nun gemeinsam mit Kollegen der ETH Zürich in ‚Cell Systems‘: je mehr Nanog vorhanden ist, desto weniger wird nachproduziert.

This work identifies Nanog’s autoregulatory motif from quantified time-lapse fluorescence lineage trees. Using STILT (Stochastic Inference on Lineage Trees), a novel particle-filter based algorithm for exact Bayesian parameter inference and model selection of stochastic models, we reject with high confidence the possibility of positive Nanog autoregulation.

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