Bolger, M.E.* ; Weisshaar, B.* ; Scholz, U.* ; Stein, N.* ; Usadel, B.* ; Mayer, K.F.X.
Plant genome sequencing - applications for crop improvement.
Curr. Opin. Biotechnol. 26, 31-37 (2013)
Bolle, C.* ; Huep, G.* ; Kleinbolting, N.* ; Haberer, G. ; Mayer, K.F.X. ; Leister, D.* ; Weisshaar, B.*
GABI-DUPLO: A collection of double mutants to overcome genetic redundancy in Arabidopsis thaliana.
Plant J. 75, 157-171 (2013)
Jia, J.* ; Zhao, S.* ; Kong, X.* ; Li, Y.* ; Zhao, G.* ; He, W.* ; Appels, R.* ; Pfeifer, M. ; Tao, Y.* ; Zhang, X.* ; Jing, R.* ; Zhang, C.* ; Ma, Y.* ; Gao, L.* ; Gao, C.* ; Spannagl, M. ; Mayer, K.F.X. ; Li, D.* ; Pan, S.* ; Zheng, F.* ; Hu, Q.* ; Xia, X.* ; Li, J.* ; Liang, Q.* ; Chen, J.* ; Wicker, T.* ; Gou, C.* ; Kuang, H.* ; He, G.* ; Luo, Y.* ; Keller, B.* ; Xia, Q.* ; Lu, P.* ; Wang, J.* ; Zou, H.* ; Zhang, R.* ; Xu, J.* ; Gao, J.* ; Middleton, C.* ; Quan, Z.* ; Liu, G.* ; International Wheat Genome Sequencing Consortium ; Yang, H.* ; Liu, X.* ; He, Z.* ; Mao, L.*
Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for wheat adaptation.
Nature 496, 91-95 (2013)
Kanter, U. ; Heller, W. ; Durner, J. ; Winkler, J.B. ; Engel, M. ; Behrendt, H. ; Holzinger, A.* ; Braun, P.* ; Hauser, M.* ; Ferreira, F.* ; Mayer, K.F.X. ; Pfeifer, M. ; Ernst, D.
Molecular and immunological characterization of ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.) pollen after exposure of the plants to elevated ozone over a whole growing season.
PLoS ONE 8:e61518 (2013)
Kopecky, D.* ; Martis, M.M. ; Cihalikova, J.* ; Hribova, E.* ; Vrana, J.* ; Bartos, J.* ; Kopecka, J.* ; Cattonaro, F.* ; Stoces, S.* ; Novak, P.* ; Neumann, P.* ; Macas, J.* ; Simková, H.* ; Studer, B.* ; Asp, T.* ; Baird, J.H.* ; Navratil, P.* ; Karafiatova, M.* ; Kubaláková, M.* ; Safar, J.* ; Mayer, K.F.X. ; Dolezel, J.*
Flow sorting and sequencing meadow fescue chromosome 4F.
Plant Physiol. 163, 1323-1337 (2013)
Kugler, K.G. ; Siegwart, G.* ; Nussbaumer, T. ; Ametz, C.* ; Spannagl, M. ; Steiner, B.* ; Lemmens, M.* ; Mayer, K.F.X. ; Buerstmayr, H.* ; Schweiger, W.*
Quantitative trait loci-dependent analysis of a gene co-expression network associated with Fusarium head blight resistance in bread wheat (Triticum aestivum L.).
BMC Genomics 14:728 (2013)
Luo, M.C.* ; Gu, Y.Q.* ; You, F.M.* ; Deal, K.R.* ; Ma, Y.* ; Hu, Y.* ; Huo, N.* ; Wang, Y.* ; Wang, J.* ; Chen, S.* ; Jorgensen, C.M.* ; Zhang, Y.* ; McGuire, P.E.* ; Pasternak, S.* ; Stein, J.C.* ; Ware, D.* ; Kramer, M.* ; McCombie, W.R.* ; Kianian, S.F.* ; Martis, M.M. ; Mayer, K.F.X. ; Sehgal, S.K.* ; Li, W.* ; Gill, B.S.* ; Bevan, M.W.* ; Simková, H.* ; Dolezel, J.* ; Weining, S.* ; Lazo, G.R.* ; Anderson, O.D.* ; Dvorak, J.*
A 4-gigabase physical map unlocks the structure and evolution of the complex genome of Aegilops tauschii, the wheat D-genome progenitor.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110, 7940-7945 (2013)
Lüpken, T.* ; Stein, N.* ; Perovic, D.* ; Habekuß, A.* ; Krämer, I.* ; Hähnel, U.* ; Steuernagel, B.* ; Scholz, U.* ; Zhou, R.* ; Ariyadasa, R.* ; Taudien, S.* ; Platzer, M.* ; Martis, M.M. ; Mayer, K.F.X. ; Friedt, W.* ; Ordon, F.*
Genomics-based high-resolution mapping of the BaMMV/BaYMV resistance gene rym11 in barley (Hordeum vulgare L.).
Theor. Appl. Genet. 126, 1201-1212 (2013)
Ma, J.* ; Stiller, J.* ; Berkman, P.J.* ; Wei, Y.* ; Rogers, J.* ; Feuillet, C.* ; Dolezel, J.* ; Mayer, K.F.X. ; Eversole, K.* ; Zheng, Y.L.* ; Liu, C.*
Sequence-based analysis of translocations and inversions in bread wheat (Triticum aestivum L.).
PLoS ONE 8:e79329 (2013)
Martis, M.M. ; Zhou, R.* ; Haseneyer, G.* ; Schmutzer, T.* ; Vrana, J.* ; Kubaláková, M.* ; König, S.* ; Kugler, K.G. ; Scholz, U.* ; Hackauf, B.* ; Korzun, V.* ; Schön, C.C.* ; Dolezel, J.* ; Bauer, E.* ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N.*
Reticulate evolution of the rye genome.
Plant Cell 25, 3685-3698 (2013)
Mascher, M.* ; Richmond, T.A.* ; Gerhardt, D.J.* ; Himmelbach, A.* ; Clissold, L.* ; Sampath, D.* ; Ayling, S.* ; Steuernagel, B.* ; Pfeifer, M. ; D'Ascenzo, M.* ; Akhunov, E.D.* ; Hedley, P.E.* ; Gonzales, A.M.* ; Morrell, P.L.* ; Kilian, B.* ; Blattner, F.R.* ; Scholz, U.* ; Mayer, K.F.X. ; Flavell, A.J.* ; Muehlbauer, G.J.* ; Waugh, R.* ; Jeddeloh, J.A.* ; Stein, N.*
Barley whole exome capture: A tool for genomic research in the genus Hordeum and beyond.
Plant J. 76, 494-505 (2013)
Mascher, M.* ; Muehlbauer, G.J.* ; Rokhsar, D.S.* ; Chapman, J.* ; Schmutz, J.* ; Barry, K.* ; Muñoz-Amatriaín, M.* ; Close, T.J.* ; Wise, R.P.* ; Schulman, A.H.* ; Himmelbach, A.* ; Mayer, K.F.X. ; Scholz, U.* ; Poland, J.A.* ; Stein, N.* ; Waugh, R.*
Anchoring and ordering NGS contig assemblies by population sequencing (POPSEQ).
Plant J. 76, 718-727 (2013)
Muñoz-Amatriaín, M.* ; Eichten, S.R.* ; Wicker, T.* ; Richmond, T.A.* ; Mascher, M.* ; Steuernagel, B.* ; Scholz, U.* ; Ariyadasa, R.* ; Spannagl, M. ; Nussbaumer, T. ; Mayer, K.F.X. ; Taudien, S.* ; Platzer, M.* ; Jeddeloh, J.A.* ; Springer, N.M.* ; Muehlbauer, G.J.* ; Stein, N.*
Distribution, functional impact, and origin mechanisms of copy number variation in the barley genome.
Genome Biol. 14:R58 (2013)
Pfeifer, M. ; Martis, M.M. ; Asp, T.* ; Mayer, K.F.X. ; Lübberstedt, T.* ; Byrne, S.* ; Frei, U.* ; Studer, B.*
The Perennial Ryegrass GenomeZipper - targeted use of genome resources for comparative grass genomics.
Plant Physiol. 161, 571-582 (2013)
Philippe, R.* ; Paux, E.* ; Bertin, I.* ; Sourdille, P.* ; Choulet, F.* ; Laugier, C.* ; Simková, H.* ; Safar, J.* ; Bellec, A.* ; Vautrin, S.* ; Frenkel, Z.* ; Cattonaro, F.* ; Magni, F.* ; Scalabrin, S.* ; Martis, M.M. ; Mayer, K.F.X. ; Korol, A.* ; Bergès, H.* ; Dolezel, J.* ; Feuillet, C.*
A high density physical map of chromosome 1BL supports evolutionary studies, map-based cloning and sequencing in wheat.
Genome Biol. 14:R64 (2013)
Poursarebani, N.* ; Ariyadasa, R.* ; Zhou, R.* ; Schulte, D.* ; Steuernagel, B.* ; Martis, M.M. ; Graner, A.* ; Schweizer, P.* ; Scholz, U.* ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N.*
Conserved synteny-based anchoring of the barley genome physical map.
Funct. Integr. Genomics 13, 339-350 (2013)
Schweiger, W.* ; Pasquet, J.C.* ; Nussbaumer, T. ; Kovalsky Paris, M.P.* ; Wiesenberger, G.* ; Macadré, C.* ; Ametz, C.* ; Berthiller, F.* ; Lemmens, M.* ; Saindrenan, P.* ; Mewes, H.-W. ; Mayer, K.F.X. ; Dufresne, M.* ; Adam, G.*
Functional characterization of two clusters of Brachypodium distachyon UDP-glycosyltransferases encoding putative deoxynivalenol detoxification genes.
Mol. Plant Microbe Interact. 26, 781-792 (2013)
Spannagl, M. ; Martis, M.M. ; Pfeifer, M. ; Nussbaumer, T. ; Mayer, K.F.X.
Analysing complex Triticeae genomes - concepts and strategies.
Plant Methods 9:35 (2013)