International Wheat Genome Sequencing Consortium (Appels, R.* ; Mayer, K.F.X. ; Rogers, J.* ; Eversole, K.* ; Feuillet, C.* ; Stein, N.* ; Keller, B.*) ; Dolezel, J.* ; Pozniak, C.* ; Gill, B.* ; Friebe, B.* ; Lukaszewski, A.J.* ; Sourdille, P.* ; Endo, T.R.* ; Kubaláková, M.* ; Cihalikova, J.* ; Dubska, Z.* ; Vrana, J.* ; Sperkova, R.* ; Simková, H.* ; Febrer, M.* ; Clissold, L.* ; McLay, K.* ; Singh, K.* ; Chhuneja, P.* ; Singh, N.K.* ; Khurana, J.P.* ; Akhunov, E.D.* ; Choulet, F.* ; Alberti, A.* ; Barbe, V.* ; Wincker, P.* ; Kanamori, H.* ; Kobayashi, F.* ; Itoh, T.* ; Matsumoto, T.* ; Sakai, H.* ; Tanaka, T.* ; Wu, J.* ; Ogihara, Y.* ; Handa, H.* ; Maclachlan, P.R.* ; Sharpe, A.* ; Klassen, D.* ; Edwards, D.* ; Batley, J.* ; Olsen, O.A.* ; Sandve, S.R.* ; Lien, S.* ; Steuernagel, B.* ; Wulff, B.* ; Caccamo, M.* ; Ayling, S.* ; Ramirez-Gonzalez, R.H.* ; Clavijo, B.J.* ; Wright, J.* ; Pfeifer, M. ; Spannagl, M. ; Martis, M.M. ; Mascher, M.* ; Chapman, J.* ; Poland, J.A.* ; Scholz, U.* ; Barry, K.* ; Waugh, R.* ; Rokhsar, D.S.* ; Muehlbauer, G.J.* ; Gundlach, H. ; Zytnicki, M.* ; Jamilloux, V.* ; Quesneville, H.* ; Wicker, T.* ; Faccioli, P.* ; Colaiacovo, M.* ; Stanca, A.M.* ; Budak, H.* ; Cattivelli, L.* ; Glover, N.* ; Pingault, L.* ; Paux, E.* ; Sharma, S. ; Appels, R.* ; Bellgard, M.* ; Chapman, B.* ; Nussbaumer, T. ; Bader, K.C. ; Rimbert, H.* ; Wang, S.* ; Knox, R.* ; Kilian, A.* ; Alaux, M.* ; Alfama, F.* ; Couderc, L.* ; Guilhot, N.* ; Viseux, C.* ; Loaec, M.* ; Praud, S.*
A chromosome-based draft sequence of the hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) genome.
Science 345:1251788 (2014)
Ariyadasa, R.* ; Mascher, M.* ; Nussbaumer, T. ; Schulte, D.* ; Frenkel, Z.* ; Poursarebani, N.* ; Zhou, R.* ; Steuernagel, B.* ; Gundlach, H. ; Taudien, S.* ; Felder, M.* ; Platzer, M.* ; Himmelbach, A.* ; Schmutzer, T.* ; Hedley, P.* ; Muehlbauer, G.* ; Scholz, U.* ; Korol, A.* ; Mayer, K.F.X. ; Waugh, R.* ; Langridge, P.* ; Graner, A.* ; Stein, N.*
A sequence-ready physical map of barley anchored genetically by two million single-nucleotide polymorphisms.
Plant Physiol. 164, 412-423 (2014)
Banaei-Moghaddam, A.M.* ; Martis, M.M. ; Macas, J.* ; Gundlach, H. ; Himmelbach, A.* ; Altschmied, L.* ; Mayer, K.F.X. ; Houben, A.*
Genes on B chromosomes: Old questions revisited with new tools.
Biochim. Biophys. Acta-Gene Regul. Mech. 1849, 64-70 (2014)
Behringer, C.* ; Bastakis, E.* ; Ranftl, Q.* ; Mayer, K.F.X. ; Schwechheimer, C.*
Functional diversification within the family of B-GATA transcription factors through the LLM-domain.
Plant Physiol. 166, 293-305 (2014)
Choulet, F.* ; Alberti, A.* ; Theil, S.* ; Glover, N.* ; Barbe, V.* ; Daron, J.* ; Pingault, L.* ; Sourdille, P.* ; Couloux, A.* ; Paux, E.* ; Leroy, P.* ; Mangenot, S.* ; Guilhot, N.* ; Le Gouis, J.* ; Balfourier, F.* ; Alaux, M.* ; Jamilloux, V.* ; Poulain, J.* ; Durand, C.* ; Bellec, A.* ; Gaspin, C.* ; Safar, J.* ; Dolezel, J.* ; Rogers, J.* ; Vandepoele, K.* ; Aury, J.M.* ; Mayer, K.F.X. ; Bergès, H.* ; Quesneville, H.* ; Wincker, P.* ; Feuillet, C.*
Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B.
Science 345:1249721 (2014)
Demko, V.* ; Perroud, P.F.* ; Johansen, W.* ; Delwiche, C.F.* ; Cooper, E.D.* ; Remme, P.* ; Ako, A.E.* ; Kugler, K.G. ; Mayer, K.F.X. ; Quatrano, R.S.* ; Olsen, O.A.*
Genetic analysis of DEK1 loop function in three-dimensional body patterning in physcomitrella patens.
Plant Physiol. 166, 903-919 (2014)
Dey, S. ; Wenig, M. ; Langen, G.* ; Sharma, S. ; Kugler, K.G. ; Knappe, C. ; Hause, B.* ; Bichlmeier, M. ; Babaeizad, V.* ; Imani, J.* ; Janzik, I.* ; Stempfl, T.* ; Hueckelhoven, R.* ; Kogel, K.H.* ; Mayer, K.F.X. ; Vlot, A.C.
Bacteria-triggered systemic immunity in barley appears to be associated with WRKY and ETHYLENE RESPONSIVE FACTORs but not with salicylic acid.
Plant Physiol. 166, 2133-2151 (2014)
Eversole, K.* ; Feuillet, C.* ; Mayer, K.F.X. ; Rogers, J.*
Slicing the wheat genome.
Science 345, 285-287 (2014)
Gläßer, C. ; Haberer, G. ; Finkemeier, I.* ; Pfannschmidt, T.* ; Kleine, T.* ; Leister, D.* ; Dietz, K.J.* ; Häusler, R.E.* ; Grimm, B.* ; Mayer, K.F.X.
Meta-analysis of retrograde signaling in Arabidopsis thaliana reveals a core module of genes embedded in complex cellular signaling networks.
Mol. Plant 7, 1167-1190 (2014)
Guo, H.* ; Wang, X.* ; Gundlach, H. ; Mayer, K.F.X. ; Peterson, D.G.* ; Scheffler, B.E.* ; Chee, P.W.* ; Paterson, A.H.*
Extensive and biased intergenomic non-reciprocal DNA exchanges shaped a nascent polyploid genome, Gossypium (cotton).
Genetics 197, 1153-1163 (2014)
Jacquemin, J.* ; Ammiraju, J.S.* ; Haberer, G. ; Billheimer, D.D.* ; Yu, Y.* ; Liu, L.C.* ; Rivera, L.F.* ; Mayer, K.F.X. ; Chen, M.* ; Wing, R.A.*
Fifteen million years of evolution in the Oryza genus shows extensive gene family expansion.
Mol. Plant 7, 642-656 (2014)
Keilwagen, J.* ; Kilian, B.* ; Özkan, H.* ; Babben, S.* ; Perovic, D.* ; Mayer, K.F.X. ; Walther, A.* ; Poskar, C.H.* ; Ordon, F.* ; Eversole, K.* ; Börner, A.* ; Ganal, M.* ; Knüpffer, H.* ; Graner, A.* ; Friedel, S.*
Separating the wheat from the chaff - a strategy to utilize plant genetic resources from ex situ genebanks.
Sci. Rep. 4:5231 (2014)
Lüpken, T.* ; Stein, N.* ; Perovic, D.* ; Habekuß, A.* ; Serfling, A.* ; Krämer, I.* ; Hähnel, U.* ; Steuernagel, B.* ; Scholz, U.* ; Ariyadasa, R.* ; Martis, M.M. ; Mayer, K.F.X. ; Niks, R.E.* ; Collins, N.C.* ; Friedt, W.* ; Ordon, F.*
High-resolution mapping of the barley Ryd3 locus controlling tolerance to BYDV.
Mol. Breed. 33, 477-488 (2014)
Marcussen, T.* ; Sandve, S.R.* ; Heier, L.* ; Spannagl, M. ; Pfeifer, M. ; International Wheat Genome Sequencing Consortium ; Jakobsen, K.S.* ; Wulff, B.B.* ; Steuernagel, B.* ; Mayer, K.F.X. ; Olsen, O.A.*
Ancient hybridizations among the ancestral genomes of bread wheat.
Science 345:1250092 (2014)
Mathew, L. S.* ; Spannagl, M. ; Al-Malki, A.* ; George, B.* ; Torres, M.F.* ; Al-Dous, E.K.* ; Al-Azwani, E. K.* ; Hussein, E.* ; Mathew, S.* ; Mayer, K.F.X. ; Mohamoud, Y. A.* ; Suhre, K. ; Malek, J. A.*
A first genetic map of date palm (Phoenix dactylifera) reveals long-range genome structure conservation in the palms.
BMC Genomics 15:285 (2014)
Nussbaumer, T. ; Kugler, K.G. ; Bader, K.C. ; Sharma, S. ; Seidel, M. ; Mayer, K.F.X.
RNASeqExpressionBrowser - a web interface to browse and visualize high-throughput expression data.
Bioinformatics 30, 2519-2520 (2014)
Nussbaumer, T. ; Kugler, K.G. ; Schweiger, W.* ; Bader, K.C. ; Gundlach, H. ; Spannagl, M. ; Poursarebani, N.* ; Pfeifer, M. ; Mayer, K.F.X.
chromoWIZ: A web tool to query and visualize chromosome-anchored genes from cereal and model genomes.
BMC Plant Biol. 14:348 (2014)
Peters, D.M.* ; Vadász, I.* ; Wujak, L.* ; Wygrecka, M.* ; Olschewski, A.* ; Becker, C.* ; Herold, S.* ; Papp, R.* ; Mayer, K.* ; Rummel, S.* ; Brandes, R.P.* ; Günther, A.* ; Waldegger, S.* ; Eickelberg, O. ; Seeger, W.* ; Morty, R.E.*
TGF-β directs trafficking of the epithelial sodium channel ENaC which has implications for ion and fluid transport in acute lung injury.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111, E374-E383 (2014)
Pfeifer, M. ; Kugler, K.G. ; Sandve, S.R.* ; Zhan, B.* ; Rudi, H.* ; Hvidsten, T.R.* ; International Wheat Genome Sequencing Consortium ; Mayer, K.F.X. ; Olsen, O.A.*
Genome interplay in the grain transcriptome of hexaploid bread wheat.
Science 345:1250091 (2014)
Poursarebani, N.* ; Nussbaumer, T. ; Simková, H.* ; Safar, J.* ; Witsenboer, H.* ; van Oeveren, J.* ; International Wheat Genome Sequencing Consortium (Schnurbusch, T.) ; Dolezel, J.* ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N.*
Whole Genome Profiling (WGP™) and shotgun sequencing delivers an anchored, gene-decorated, physical map assembly of bread wheat chromosome 6A.
Plant J. 79, 334-347 (2014)
Schlicke, H.* ; Hartwig, A.S.* ; Firtzlaff, V.* ; Richter, A.S.* ; Glässer, C.* ; Mayer, K.F.X. ; Finkemeier, I.* ; Grimm, B.*
Induced deactivation of genes encoding chlorophyll biosynthesis enzymes disentangles tetrapyrrole-mediated retrograde signalling.
Mol. Plant 7, 1211-1227 (2014)
Tang, H.* ; Krishnakumar, V.* ; Bidwell, S.* ; Rosen, B.* ; Chan, A.* ; Zhou, S.* ; Gentzbittel, L.* ; Childs, K.L.* ; Yandell, M.D.* ; Gundlach, H. ; Mayer, K.F.X. ; Schwartz, D.C.* ; Town, C.D.*
An improved genome release (version Mt4.0) for the model legume Medicago truncatula.
BMC Genomics 15:312 (2014)
Unterseer, S.* ; Bauer, E.* ; Haberer, G. ; Seidel, M. ; Knaak, C.* ; Ouzunova, M.* ; Meitinger, T. ; Strom, T.M. ; Fries, R.* ; Pausch, H.* ; Bertani, C.* ; Davassi, A.* ; Mayer, K.F.X. ; Schön, C.C.*
A powerful tool for genome analysis in maize: Development and evaluation of the high density 600k SNP genotyping array.
BMC Genomics 15:823 (2014)
Wang, M.* ; Yu, Y.* ; Haberer, G. ; Marri, P.R.* ; Fan, C.* ; Goicoechea, J.L.* ; Zuccolo, A.* ; Song, X.* ; Kudrna, D.* ; Ammiraju, J.S.* ; Cossu, R.M.* ; Maldonado, C.* ; Chen, J.* ; Lee, S.* ; Sisneros, N.* ; de Baynast, K.* ; Golser, W.* ; Wissotski, M.* ; Kim, W.J.* ; Sanchez, P.* ; Ndjiondjop, M.N.* ; Sanni, K.* ; Long, M.* ; Carney, J.* ; Panaud, O.* ; Wicker, T.* ; Machado, C.A.* ; Chen, M.* ; Mayer, K.F.X. ; Rounsley, S.* ; Wing, R.A.*
The genome sequence of African rice (Oryza glaberrima) and evidence for independent domestication.
Nat. Genet. 46, 982-988 (2014)
Wang, W.* ; Haberer, G. ; Gundlach, H. ; Gläßer, C. ; Nussbaumer, T. ; Luo, M.C.* ; Lomsadze, A.* ; Borodovsky, M.* ; Kerstetter, R.A.* ; Shanklin, J.* ; Byrant, D.W.* ; Mockler, T.C.* ; Appenroth, K.J.* ; Grimwood, J.* ; Jenkins, J.* ; Chow, J.* ; Choi, C.* ; Adam, C.* ; Cao, X.H.* ; Fuchs, J.* ; Schubert, I.* ; Rokhsar, D.* ; Schmutz, J.* ; Michael, T.P.* ; Mayer, K.F.X. ; Messing, J.*
The Spirodela polyrhiza genome reveals insights into its neotenous reduction fast growth and aquatic lifestyle.
Nat. Commun. 5:3311 (2014)
Weßling, R.* ; Epple, P.* ; Altmann, S.* ; He, Y.* ; Yang, L.* ; Henz, S.R.* ; McDonald, N.* ; Wiley, K.* ; Bader, K.C. ; Gläßer, C. ; Mukhtar, M.S.* ; Haigis, S.* ; Ghamsari, L.* ; Stephens, A.E.* ; Ecker, J.R.* ; Vidal, M.* ; Jones, J.D.* ; Mayer, K.F.X. ; ver Loren van Themaat, E.* ; Weigel, D.* ; Schulze-Lefert, P.* ; Dangl, J.L.* ; Panstruga, R.* ; Braun, P.*
Convergent targeting of a common host protein-network by pathogen effectors from three kingdoms of life.
Cell Host Microbe 16, 364-375 (2014)