Avni, R.* ; Nave, M.* ; Barad, O.* ; Baruch, K.* ; Twardziok, S.O. ; Gundlach, H. ; Hale, I.* ; Mascher, M.* ; Spannagl, M. ; Wiebe, K.* ; Jordan, K.W.* ; Golan, G.* ; Deek, J.* ; Ben-Zvi, B.* ; Ben-Zvi, G.* ; Himmelbach, A.* ; MacLachlan, R.P.* ; Sharpe, A.G.* ; Fritz, A.* ; Ben-David, R.* ; Budak, H.* ; Fahima, T.* ; Korol, A.* ; Faris, J.D.* ; Hernandez, A.* ; Mikel, M.A.* ; Levy, A.A.* ; Steffenson, B.* ; Maccaferri, M.* ; Tuberosa, R.* ; Cattivelli, L.* ; Faccioli, P.* ; Ceriotti, A.* ; Kashkush, K.* ; Pourkheirandish, M.* ; Komatsuda, T.* ; Eilam, T.* ; Sela, H.* ; Sharon, A.* ; Ohad, N.* ; Chamovitz, D.A.* ; Mayer, K.F.X. ; Stein, N.* ; Ronen, G.M.* ; Peleg, Z.* ; Pozniak, C.J.* ; Akhunov, E.D.* ; Distelfeld, A.*
Wild emmer genome architecture and diversity elucidate wheat evolution and domestication.
Science 357, 93-97 (2017)
Bolger, M.E.* ; Schwacke, R.* ; Gundlach, H. ; Schmutzer, T.* ; Chen, J.* ; Arend, D.* ; Oppermann, M.* ; Weise, S.M.* ; Lange, M.* ; Fiorani, F.* ; Spannagl, M. ; Scholz, U.* ; Mayer, K.F.X. ; Usadel, B.*
From plant genomes to phenotypes.
J. Biotechnol. 17, 46-52 (2017)
Fuchs, H. ; Aguilar-Pimentel, A. ; Amarie, O.V. ; Becker, L. ; Calzada-Wack, J.C. ; Cho, Y.-L. ; Garrett, L. ; Hölter, S.M. ; Irmler, M. ; Kistler, M. ; Kraiger, M.J. ; Mayer-Kuckuk, P. ; Moreth, K. ; Rathkolb, B. ; Rozman, J. ; da Silva Buttkus, P. ; Treise, I. ; Zimprich, A. ; Gampe, K. ; Hutterer, C. ; Leuchtenberger, S. ; Maier, H. ; Miller, M. ; Scheideler, A. ; Wu, M. ; Beckers, J. ; Bekeredjian, R.* ; Brielmeier, M. ; Busch, D.H.* ; Klingenspor, M.* ; Klopstock, T.* ; Ollert, M.* ; Schmidt-Weber, C.B. ; Stöger, T. ; Wolf, E.* ; Wurst, W. ; Yildirim, A.Ö. ; Zimmer, A.* ; Gailus-Durner, V. ; Hrabě de Angelis, M.
Understanding gene functions and disease mechanisms: Phenotyping pipelines in the German Mouse Clinic.
Behav. Brain Res. 352, 187-196 (2017)
Grübler, B.* ; Merendino, L.* ; Twardziok, S.O. ; Mininno, M.* ; Allorent, G.* ; Chevalier, F.* ; Liebers, M.* ; Blanvillain, R.* ; Mayer, K.F.X. ; Lerbs-Mache, S.* ; Ravanel, S.* ; Pfannschmidt, T.*
Light and plastid signals regulate different sets of genes in the albino mutant pap7-1.
Plant Physiol. 175, 1203-1219 (2017)
Lang, D. ; Ullrich, K.K.* ; Murat, F.* ; Fuchs, J.* ; Jenkins, J.* ; Haas, F.B.* ; Piednoël, M.* ; Gundlach, H. ; Van Bel, M.* ; Meyberg, R.* ; Vives, C.* ; Morata, J.* ; Symeonidi, A.* ; Hiss, M.* ; Muchero, W.* ; Kamisugi, Y.* ; Saleh, O.* ; Blanc, G.* ; Decker, E.L.* ; van Gessel, N.* ; Grimwood, J.* ; Hayes, R.D.* ; Graham, S.W.* ; Gunter, L.E.* ; McDaniel, S.* ; Hoernstein, S.N.W.* ; Larsson, A.* ; Li, F.W.* ; Perroud, P.F.* ; Phillips, J.A.* ; Ranjan, P.* ; Rokshar, D.S.* ; Rothfels, C.J.* ; Schneider, L.* ; Shu, S.Q.* ; Stevenson, D.W.* ; Thümmler, F.* ; Tillich, M.* ; Villarreal A, J.C.* ; Widiez, T.* ; Wong, G.K.* ; Wymore, A.* ; Zhang, Y.* ; Zimmer, A.D.* ; Quatrano, R.S.* ; Mayer, K.F.X. ; Goodstein, D.* ; Casacuberta, J.M.* ; Vandepoele, K.* ; Reski, R.* ; Cuming, A.C.* ; Tuskan, J.* ; Maumus, F.* ; Salse, J.* ; Schmutz, J.* ; Rensing, S.A.*
The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution.
Plant J. 93, 515-533 (2017)
Luo, M.C.* ; Gu, Y.Q.* ; Puiu, D.* ; Wang, H.* ; Twardziok, S.O. ; Deal, K.R.* ; Huo, N.* ; Zhu, T.* ; Wang, L.* ; Wang, Y.* ; McGuire, P.E.* ; Liu, S.* ; Long, H.* ; Ramasamy, R.K.* ; Rodriguez, J.C.* ; Van, S.L.* ; Yuan, L.Y.* ; Wang, Z.* ; Xia, Z.L.* ; Xiao, L.* ; Anderson, O.D.* ; Ouyang, S.* ; Liang, Y.* ; Zimin, A.V.* ; Pertea, G.* ; Qi, P.* ; Bennetzen, J.L.* ; Dai, X.* ; Dawson, M.W.* ; Müller, H.G.* ; Kugler, K.G. ; Rivarola-Duarte, L. ; Spannagl, M. ; Mayer, K.F.X. ; Lu, F.H.* ; Bevan, M.W.* ; Leroy, P.* ; Li, P.* ; You, F.M.* ; Sun, Q.* ; Liu, Z.* ; Lyons, E.* ; Wicker, T.* ; Salzberg, S.L.* ; Devos, K.M.* ; Dvořák, J.*
Genome sequence of the progenitor of the wheat D genome Aegilops tauschii.
Nature 551, 498-502 (2017)
Lutz, U.* ; Nussbaumer, T. ; Spannagl, M. ; Diener, J.* ; Mayer, K.F.X. ; Schwechheimer, C.*
Natural haplotypes of FLM non-coding sequences fine-tune flowering time in ambient spring temperatures in Arabidopsis.
eLife 6:e22114 (2017)
Mascher, M.* ; Gundlach, H. ; Himmelbach, A.* ; Beier, S.* ; Twardziok, S.O. ; Wicker, T.* ; Radchuk, V.* ; Dockter, C.* ; Hedley, P.E.* ; Russell, J.A.* ; Bayer, M.* ; Ramsay, L.* ; Liu, H.* ; Haberer, G. ; Zhang, X.Q.* ; Zhang, Q.* ; Barrero, R.A.* ; Li, L.* ; Taudien, S.* ; Groth, M.* ; Felder, M.* ; Hastie, A.* ; Šimková, H.* ; Staňková, H.* ; Vrána, J.* ; Chan, S.W.* ; Muñoz-Amatriaín, M.* ; Ounit, R.* ; Wanamaker, S.* ; Bolser, D.* ; Colmsee, C.* ; Schmutzer, T.* ; Aliyeva-Schnorr, L.* ; Grasso, S.* ; Tanskanen, J.* ; Chailyan, A.* ; Sampath, D.* ; Heavens, D.* ; Clissold, L.* ; Cao, S.* ; Chapman, B.* ; Dai, F.* ; Han, Y.* ; Li, H.* ; Li, X.* ; Lin, C.* ; McCooke, J.K.* ; Tan, C.S.* ; Wang, P.* ; Wang, S.* ; Yin, S.* ; Zhou, G.* ; Poland, J.A.* ; Bellgard, M.I.* ; Borisjuk, L.* ; Houben, A.* ; Doležel, J.* ; Ayling, S.* ; Lonardi, S.* ; Kersey, P.* ; Langridge, P.* ; Muehlbauer, G.J.* ; Clark, M.D.* ; Caccamo, M.* ; Schulman, A.H.* ; Mayer, K.F.X.* ; Platzer, M.* ; Close, T.J.* ; Scholz, U.* ; Hansson, M.* ; Zhang, G.* ; Braumann, I.* ; Spannagl, M. ; Li, C.* ; Waugh, R.* ; Stein, N.*
A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome.
Nature 544, 427-433 (2017)
Müller, H.M.* ; Schäfer, N.* ; Bauer, H.* ; Geiger, D.* ; Lautner, S.* ; Fromm, J.* ; Riederer, M.* ; Bueno, A.* ; Nussbaumer, T. ; Mayer, K.F.X. ; Alquraishi, S.A.* ; Alfarhan, A.H.* ; Neher, E.* ; Al-Rasheid, K.A.S.* ; Ache, P.* ; Hedrich, R.*
The desert plant Phoenix dactylifera closes stomata via nitrate-regulated SLAC1 anion channel.
New Phytol. 216, 150-162 (2017)
Prade, V.M. ; Gundlach, H. ; Twardziok, S.O. ; Chapman, B.* ; Tan, C.S.* ; Langridge, P.* ; Schulman, A.H.* ; Stein, N.* ; Waugh, R.* ; Zhang, G.* ; Platzer, M.* ; Li, C.* ; Spannagl, M. ; Mayer, K.F.X.
The pseudogenes of barley.
Plant J. 93, 502-514 (2017)
Safronov, O.* ; Kreuzwieser, J.* ; Haberer, G. ; Alyousif, M.S.* ; Schulze, W.* ; Al-Harbi, N.* ; Arab, L.* ; Ache, P.* ; Stempfl, T.* ; Kruse, J.* ; Mayer, K.X. ; Hedrich, R.* ; Rennenberg, H.* ; Salojärvi, J.* ; Kangasjärvi, J.*
Detecting early signs of heat and drought stress in Phoenix dactylifera (date palm).
PLoS ONE 12:e0177883 (2017)
Samad-Zamini, M.* ; Schweiger, W.* ; Nussbaumer, T. ; Mayer, K.F.X. ; Buerstmayr, H.*
Time-course expression QTL atlas of the global transcriptional response of wheat to Fusarium graminearum.
Plant Biotechnol. J. 15, 1453–1464 (2017)
Schmutzer, T.* ; Bolger, M.E.* ; Rudd, S.* ; Chen, J.* ; Gundlach, H. ; Arend, D.* ; Oppermann, M.* ; Weise, S.M.* ; Lange, M.* ; Spannagl, M. ; Usadel, B.* ; Mayer, K.F.X. ; Scholz, U.*
Bioinformatics in the plant genomic and phenomic domain: The German contribution to resources, services and perspectives.
J. Biotechnol. 261, 37-45 (2017)
Spannagl, M. ; Nussbaumer, T. ; Bader, K.C. ; Gundlach, H. ; Mayer, K.F.X.
PGSB/MIPS plantsDB database framework for the integration and analysis of plant genome data.
Methods Mol. Biol. 1533, 33-44 (2017)
Wicker, T.* ; Schulman, A.H.* ; Tanskanen, J.* ; Spannagl, M. ; Twardziok, S.O. ; Mascher, M.* ; Springer, N.M.* ; Li, Q.* ; Waugh, R.* ; Li, C.* ; Zhang, G.* ; Stein, N.* ; Mayer, K.F.X.* ; Gundlach, H.
The repetitive landscape of the 5100 Mbp barley genome.
Mob. DNA 8:22 (2017)