Baskin, I.I.* ; Winkler, D.* ; Tetko, I.V.
A renaissance of neural networks in drug discovery.
Expert Opin. Drug Discov. 11, 785-795 (2016)
Nokwe, C.N.* ; Hora, M. ; Zacharias, M.* ; Yagi, H.* ; Peschek, J.* ; Reif, B. ; Goto, Y.* ; Buchner, J.*
A stable mutant predisposes antibody domains to amyloid formation through specific non-native interactions.
J. Mol. Biol. 428, 1315-1332 (2016)
Tetko, I.V. ; Engkvist, O.* ; Koch, U.* ; Reymond, J.L.* ; Chen, H.*
BIGCHEM: Challenges and opportunities for big data analysis in chemistry.
Mol. Inform. 35, 615-621 (2016)
Mansouri, K.* ; Abdelaziz, A. ; Rybacka, A.* ; Roncaglioni, A.* ; Tropsha, A.* ; Varnek, A.* ; Zakharov, A.* ; Worth, A.* ; Richard, A.M.* ; Grulke, C.M.* ; Trisciuzzi, D.* ; Fourches, D.* ; Horvath, D.* ; Benfenati, E.* ; Muratov, E.* ; Wedebye, E.B.* ; Grisoni, F.* ; Mangiatordi, G.F.* ; Incisivo, G.M.* ; Hong, H.* ; Ng, H.W.* ; Tetko, I.V. ; Balabin, I.* ; Kancherla, J.* ; Shen, J.* ; Burton, J.* ; Nicklaus, M.* ; Cassotti, M.* ; Nikolov, N.G.* ; Nicolotti, O.* ; Andersson, P.L.* ; Zang, Q.* ; Politi, R.* ; Beger, R.D.* ; Todeschini, R.* ; Huang, R.J.* ; Farag, S.* ; Rosenberg, S.A.* ; Slavov, S.* ; Hu, X.* ; Judson, R.S.*
CERAPP: Collaborative estrogen receptor activity prediction project.
Environ. Health Perspect. 124, 1023-1033 (2016)
Abdelaziz, A.* ; Spahn-Langguth, H.* ; Schramm, K.-W. ; Tetko, I.V.
Consensus modeling for HTS assays using in silico descriptors calculates the best balanced accuracy in Tox21 challenge.
Front. Env. Sci. 4:2 (2016)
Janowski, R. ; Scanu, S. ; Niessing, D. ; Madl, T.
Crystal and solution structural studies of mouse phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase 4.
Act. Cryst. F 72, 743-749 (2016)
Subramaniam, S.* ; Erler, A.* ; Fu, J.* ; Kranz, A.* ; Tang, J.* ; Gopalswamy, M. ; Ramakrishnan, S.* ; Keller, A.* ; Grundmeier, G.* ; Müller, D.* ; Sattler, M. ; Stewart, A.F.*
DNA annealing by Redβ is insufficient for homologous recombination and the additional requirements involve intra- and inter-molecular interactions.
Sci. Rep. 6, 34525 (2016)
Tetko, I.V. ; Engkvist, O.* ; Chen, H.*
Does 'Big Data' exist in medicinal chemistry, and if so, how can it be harnessed?
Future Med. Chem. 8, 1801-1806 (2016)
Salmina, E.S.* ; Haider, N.* ; Tetko, I.V.
Extended Functional Groups (EFG): An efficient set for chemical characterization and structure-activity relationship studies of chemical compounds.
Molecules 21, DOI: 10.3390/molecules21010001 (2016)
Brenke, J.K. ; Salmina, E.S.* ; Ringelstetter, L. ; Dornauer, S. ; Kuzikov, M.* ; Rothenaigner, I. ; Schorpp, K.K. ; Giehler, F. ; Gopalakrishnan, J.* ; Kieser, A. ; Gul, S.* ; Tetko, I.V. ; Hadian, K.
Identification of small-molecule frequent hitters of glutathione S-transferase-glutathione interaction.
J. Biomol. Screen. 21, 596-607 (2016)
Sarkar, R. ; Mainz, A. ; Busi, B. ; Barbet-Massin, E. ; Kranz, M.* ; Hofmann, T.* ; Reif, B.
Immobilization of soluble protein complexes in MAS solid-state NMR: Sedimentation versus viscosity.
Solid State Nucl. Magn. Reson. 76-77, 7-14 (2016)
Zierer, B.K.* ; Rübbelke, M. ; Tippel, F.* ; Madl, T. ; Schopf, F.H.* ; Rutz, D.A.* ; Richter, K.* ; Sattler, M. ; Buchner, J.*
Importance of cycle timing for the function of the molecular chaperone Hsp90.
Nat. Struct. Mol. Biol. 23, 1020-1028 (2016)
Carlon, A.* ; Ravera, E.* ; Hennig, J. ; Parigi, G.* ; Sattler, M. ; Luchinat, C.*
Improved accuracy from joint X-ray and NMR refinement of a protein-RNA complex structure.
J. Am. Chem. Soc. 138, 1601-1610 (2016)
Vincendeau, M. ; Hadian, K. ; Messias, A.C. ; Brenke, J.K. ; Halander, J. ; Griesbach, R.A. ; Greczmiel, U. ; Bertossi, A. ; Stehle, R. ; Nagel, D. ; Demski, K. ; Velvarska, H. ; Niessing, D. ; Geerlof, A. ; Sattler, M. ; Krappmann, D.
Inhibition of canonical NF-κB signaling by a small molecule targeting NEMO-ubiquitin interaction.
Sci. Rep. 6:18934 (2016)
Delaforge, E.* ; Milles, S.* ; Huang, J.R.* ; Bouvier, D.* ; Jensen, M.R.* ; Sattler, M. ; Hart, D.J.* ; Blackledge, M.J.*
Investigating the role of large-scale domain dynamics in protein-protein interactions.
Front. Mol. Biosci. 3, 54 (2016)
Zheng, X.* ; Ramani, A.* ; Soni, K. ; Gottardo, M.* ; Zheng, S.* ; Gooi, L.M.* ; Li, W.* ; Feng, S.* ; Mariappan, A.* ; Wason, A.* ; Widlund, P.* ; Pozniakovsky, A.* ; Poser, I.* ; Deng, H.* ; Ou, G.* ; Riparbelli, M.* ; Giuliano, C.* ; Hyman, A.A.* ; Sattler, M. ; Gopalakrishnan, J.* ; Li, H.*
Molecular basis for CPAP-tubulin interaction in controlling centriolar and ciliary length.
Nat. Commun. 7:11874 (2016)
Jung, B. ; Messias, A.C. ; Schorpp, K.K. ; Geerlof, A. ; Schneider, G.* ; Saur, D.* ; Hadian, K. ; Sattler, M. ; Wanker, E.E.* ; Hasenöder, S. ; Lickert, H.
Novel small molecules targeting ciliary transport of smoothened and oncogenic Hedgehog pathway activation.
Sci. Rep. 6:22540 (2016)
Jung, B. ; Padula, D. ; Burtscher, I. ; Landerer, C. ; Lutter, D. ; Theis, F.J. ; Messias, A.C. ; Geerlof, A. ; Sattler, M. ; Kremmer, E. ; Boldt, K. ; Ueffing, M. ; Lickert, H.
Pitchfork and Gprasp2 target smoothened to the primary cilium for Hedgehog pathway activation.
PLoS ONE 11:e0149477 (2016)
Tetko, I.V. ; Varbanov, H.P.* ; Galanski, M.* ; Talmaciu, M.* ; Platts, J.A.* ; Ravera, M.* ; Gabano, E.*
Prediction of logP for Pt(II) and Pt(IV) complexes: Comparison of statistical and quantum-chemistry based approaches.
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Jagtap, P.K. ; Garg, D. ; Kapp, T.G.* ; Will, C.L.* ; Demmer, O.* ; Lührmann, R.* ; Kessler, H.* ; Sattler, M.
Rational design of cyclic peptide inhibitors of U2AF homology motif (UHM) domains to modulate pre-mRNA splicing.
J. Med. Chem. 59, 10190-10197 (2016)
Von Voithenberg, L.V.* ; Sanchez-Rico, C. ; Kang, H.-S. ; Madl, T. ; Zanier, K.* ; Barth, A.S.* ; Warner, L. ; Sattler, M. ; Lamb, D.C.*
Recognition of the 3′ splice site RNA by the U2AF heterodimer involves a dynamic population shift.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113, E7169-E7175 (2016)
Schlundt, A. ; Niessing, D. ; Heissmeyer, V. ; Sattler, M.
RNA recognition by Roquin in posttranscriptional gene regulation.
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Janowski, R. ; Heinz, G.A. ; Schlundt, A. ; Wommelsdorf, N. ; Brenner, S. ; Gruber, A.R.* ; Blank, M.* ; Buch, T.* ; Buhmann, R.* ; Zavolan, M.* ; Niessing, D. ; Heissmeyer, V. ; Sattler, M.
Roquin recognizes a non-canonical hexaloop structure in the 3'-UTR of Ox40.
Nat. Commun. 7:11032 (2016)
Dallmann, A. ; Beribisky, A.V. ; Gnerlich, F.* ; Rübbelke, M. ; Schiesser, S.* ; Carell, T.* ; Sattler, M.
Site-specific isotope-labeling of inosine phosphoramidites and NMR analysis of an inosine-containing RNA duplex.
Chem. Eur. J. 22, 15350-15359 (2016)
Morgen, M.* ; Jöst, C.* ; Malz, M.* ; Janowski, R. ; Niessing, D. ; Klein, C.D.* ; Gunkel, N.* ; Miller, A.K.*
Spiroepoxytriazoles are fumagillin-like irreversible inhibitors of MetAP2 with potent cellular activityγ.
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Mourao, A. ; Bonnal, S.* ; Soni, K. ; Warner, L. ; Bordonné, R.* ; Valcárcel, J.* ; Sattler, M.
Structural basis for the recognition of spliceosomal SmN/B/B’ proteins by the RBM5 OCRE domain in splicing regulation.
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Weber, J. ; Bao, H.* ; Hartlmüller, C.* ; Wang, Z.* ; Windhager, A. ; Janowski, R. ; Madl, T. ; Jin, P.* ; Niessing, D.
Structural basis of nucleic-acid recognition and double-strand unwinding by the essential neuronal protein Pur-alpha.
eLife 5:e11297 (2016)
Feracci, M.* ; Foot, J.N.* ; Grellscheid, S.N.* ; Danilenko, M.* ; Stehle, R.* ; Gonchar, O.* ; Kang, H.-S. ; Dalgliesh, C.* ; Meyer, N.H. ; Liu, Y.* ; Lahat, A.* ; Sattler, M. ; Eperon, I.C.* ; Elliott, D.J.* ; Dominguez, C.*
Structural basis of RNA recognition and dimerization by the STAR proteins T-STAR and Sam68.
Nat. Commun. 7:10355 (2016)
Emmanouilidis, L. ; Gopalswamy, M. ; Passon, D.M.* ; Wilmanns, M.* ; Sattler, M.
Structural biology of the import pathways of peroxisomal matrix proteins.
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Guaitoli, G.* ; Raimondi, F.* ; Gilsbach, B.K.* ; Gómez-Llorente, Y.* ; Deyaert, E.* ; Renzi, F.* ; Li, X.* ; Schaffner, A.* ; Jagtap, P.K. ; Boldt, K.* ; von Zweydorf, F.* ; Gotthardt, K.* ; Lorimer, D.D.* ; Yue, Z.* ; Burgin, A.* ; Janjic, N.* ; Sattler, M. ; Versées, W.* ; Ueffing, M.* ; Ubarretxena-Belandia, I.* ; Kortholt, A.* ; Gloeckner, C.J.*
Structural model of the dimeric Parkinson's protein LRRK2 reveals a compact architecture involving distant interdomain contacts.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113, E4357-E4366 (2016)
Prade, E.* ; Barucker, C.* ; Sarkar, R.* ; Althoff-Ospelt, G.* ; Lopez del Amo, J.M.* ; Hossain, S.* ; Zhong, Y.* ; Multhaup, G.* ; Reif, B.
Sulindac sulfide induces the formation of large oligomeric aggregates of the Alzheimer's disease amyloid-β peptide which exhibit reduced neurotoxicity.
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The development of models to predict melting and pyrolysis point data associated with several hundred thousand compounds mined from PATENTS.
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Giannopoulou, E.A.* ; Emmanouilidis, L. ; Sattler, M. ; Dodt, G.* ; Wilmanns, M.*
Towards the molecular mechanism of the integration of peroxisomal membrane proteins.
Biochim. Biophys. Acta-Mol. Cell Res. 1863, 863-869 (2016)
Novotarskyi, S.* ; Abdelaziz, A.* ; Sushko, Y.* ; Körner, R.* ; Vogt, J.* ; Tetko, I.V.
ToxCast EPA in vitro to in vivo challenge: Insight into the rank-I model.
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